Vyspělé elektronické systémy stability jízdy, ke kterým patří ESP včetně ABS, EBV, MSR, ASR, EDS, HBA, DSR a ESBS, se staly již samozřejmou součástí standardní výbavy vozů Octavia již od verze Classic a poskytují vysokou úroveň ochrany cestujících i ostatních účastníků silničního provozu.
V oblasti pasivní bezpečnosti představují hlavní inovaci přední hlavové opěrky WOKS, jejichž tvar lépe chrání krční páteř cestujících na předních sedadlech při nárazu zezadu. Samozřejmostí jsou airbagy řidiče a spolujezdce, boční airbagy předu a hlavové airbagy, přičemž airbag spolujezdce lze v případě potřeby deaktivovat.